O início do funcionamento da Faculdade STBNB, não altera a estrutura funcional do STBNB. Na verdade, são ampliadas as atividades da Instituição que continua oferecendo, aos que já estavam matriculados, seu curso livre e ampliada com seus cursos regulares de Bacharelado em Teologia e Licenciatura em Música. A Direção Geral do STBNB e também da Faculdade STBNB é de responsabilidade do Dc. Lyncoln Araújo, cabendo, de igual modo, a Profa e Doutoranda - Maria Betânia a Coordenação Acadêmica e de Teologia e a Coordenação de Música a Profa e doutoranda – Valdiene Pereira. No tocante a gestão funcional, as substituições da direção será sempre nesta ordem: ausência do diretor geral, responderá pelas Instituições STBNB/Faculdade STBNB a Profa Maria Betânia. Em caso de ausência da direção geral e Coordenadora Acadêmica e de Teologia, responderá pela direção geral do STBNB/Faculdade STBNB a Profa Valdiene Pereira. Oportunamente, na medida em que forem operacionalizados, serão nominados os Conselhos, Núcleos, supervisões. A base funcional são sofreu alteração alguma.